C’est en mai 1932 que la compagnie Air Union ouvre la toute première liaison directe entre Paris et Genève à raison de trois aller-retours hebdomadaires, jusqu’en 1935.
Air France propose dès lors un tronçon Lyon-Genève avant de reprendre, le 15 mai 1937; Paris-Genève sans escale.
Stoppée durant la deuxième guerre mondiale, la liaison est rétablie par Swissair et Air France en juillet 1945 et devient quotidienne dès 1946, à l’instar de Paris-Zurich.
En avril 1953, ce ne sont ainsi pas moins de 14 vols hebdomadaires qui relient Le Bourget et Genève. Quand la Caravelle remplace le Vicker « Viscount », fin 1959, la deuxième ville de Suisse n’est plus qu’à 40 minutes de Paris. Pour faire face au succès grandissant de la ligne, Air France met en service, au début de l’année 1968, un Boeing 707. L’appareil peut transporter 142 passagers à une vitesse de croisière de 900 km/h.
La concurrence ferroviaire se fait cependant de plus en plus rude et, en 1984, le succès de la ligne TGV reliant Paris et Genève oblige Air France à s’adapter. La compagnie continue cependant sa croissance et, de six fréquences au début des années 1990, elle offre jusqu’à 11 liaisons durant l’hiver 2005.
À l’heure actuelle, Air France propose environ 10 vols quotidiens vers Genève en Airbus, au départ de Paris-Charles de Gaulle.